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Spatial transcriptomic and single-nucleus analysis reveals heterogeneity in a gigantic single-celled syncytium この研究は、単一細胞の巨大な多核体である粘菌(特にPhysarum polycephalum)の遺伝子発現の不均一性を明らかにする #学ぶ
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https://elifesciences.org/articles/69745 主な内容は以下の通りです。空間的トランスクリプトーム解析:粘菌の異なる領域や構造における遺伝子発現の違いを調べ、特定の形態や環境条件と関連する遺伝子発現パターンがあることを示しました。例えば、成長前線(ファン)とネットワーク(静脈)領域で異なる遺伝子発現が観察されました。 単一核RNAシーケンス(snRNA-seq)解析:粘菌内の個々の核が転写プロファイルにおいて不均一であることを明らかにしました。核の多様性は、その位置(成長前線かネットワークか)と関連していることが示唆されました。 アメーバ段階との比較:単核アメーバ細胞の遺伝子発現を解析し、多核体の核との違いを比較しました。これにより、細胞分裂の様式(サイトカインシスを伴う開放型有糸分裂と、核分裂のみの閉鎖型有糸分裂)に関連する遺伝子発現の差異が明らかになりました。 この研究は、単一細胞生物でありながら複雑な構造と行動を示す粘菌が、どのようにして領域特異的な遺伝子発現を制御し、環境変化に適応しているのかを探求しています。