FastaファイルのGC含量を計算する(Biopythonを使う)
以下です。
from Bio.SeqUtils import GC
import sys
args = sys.argv
f = open (args[1], 'r')
sequence = ""
for line in f:
if not line.startswith('>'):
sequence = sequence + line.rstrip()
GC_content = GC(sequence)
print(GC_content)