MGI-seqとは


-->MGI-seqは、中国のMGIという会社が作った次世代シーケンサーです。現在次世代シーケンサーは、ほぼIlluminaの１強になっておりますが、MGIもこれからどんどん伸びていくと思われます。

それぞれ、もっともパワフルな機器のアウトプットは以下の通り。
-->
Illumina NovaseqMGI MGI-seq T7
Maximum Output6000 Gb6000 Gb
Maximum Reads Per Run12 G reads20 G reads
Maximum Read Length2 x 2502 x 150

これをみると、アウトプットはほぼ変わらない様子。おそらくMGI-seqはリード数がどんどん伸びてくると思います。

原理

こちらの動画がわかりやすいです。

大まかな流れとしては、

  1. DNA extraction
  2. DNA fragmentation
  3. End repair
  4. Adapter ligation
  5. single strand separation <- li="">
  6. circularization
  7. Make DNA nano ball (DNB)
  8. Load DNB to flow cell
  9. cPAS sequencing


cPAS sequencing

combinatorial probe-anchor synthesisの略。

こちらに詳しく説明されています。



メリットは、シーケンスアレイを作るのに、PCRを使わないところだそうです。
引用は以下の通り。
An important advantage of this technique compared to the previously mentioned sequencing systems is in that no PCR is applied in preparing sequencing arrays

https://clinicalepigeneticsjournal.biomedcentral.com/track/pdf/10.1186/s13148-016-0287-1