Evaluation of ultra-low input RNA sequencing for the study of human T cell transcriptome

https://www.nature.com/articles/s41598-019-44902-z.pdf

Ampliseqとは、ターゲットの遺伝子のプライマーを入れて増幅させる方法

SMARTseqとAmpliseqを比較

SMARTseqだと、細胞数が減少するにしたがって、遺伝子数が減る。

Ampliseqはそんなことがない。

SMARTseqは、Non-coding geneを検出できる。

Ampliseqはできない。

1000細胞程度ならどの方法でも問題ない。

100細胞ぐらいならAmpliseqがいい。

#微量RNA-seq

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