sars-cov2 (新型コロナウイルス)のゲノムに、2箇所HIVと同じ配列が含まれている?
sars-cov2 (新型コロナウイルス)のゲノムに、2箇所HIVと同じ配列が含まれていると友人が言っていた。それが真実かどうなのか調べてみる。
まず、sars-cov2の配列は以下の通り
1798172431 - Nucleotide Result
一方、HIV1の配列は以下の通り
https://www.ncbi.nlm.nih.gov/nuccore/NC_001802?report=fasta
makeblastdb -in sars-cov2.fasta -dbtype nucl -out sars-cov2
magicblast -query hiv.fasta -db sars-cov2 -infmt fasta -outfmt tabular -out hiv-sars
マッチしなかった
https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC7033698/
こちらの論文によると似ているところはあるものの生物共通なところなので、可能性が低いということらしい