GitHub - mojaveazure/seurat-disk: Interfaces for HDF5-based Single Cell File Formats 上記を参照 R上でインストール if (!requireNamespace("remotes", quietly = TRUE)) { install.packages("remotes") } remotes::install_github("mojaveazure/seurat-disk") Seurat DiskをR上で起動してみる library(SeuratDisk) しかしエラーとなる エラー: package or namespace load failed for 'SeuratDisk' in loadNamespace(i, c(lib.loc, .libPaths()), versionCheck = vI[[i]]): 名前空間 'htmltools' 0.5.3 は既にロードされましたが、>= 0.5.4 が要求されています どうやらhtmltoolsを最新にしないといけないらしい。ということでhtmltoolsを再インストール install.packages('htmltools') するとこういう警告が出る。ここで”No”を選択する。”Yes”を選択すると何故かエラーになる。 htmltoolsがインストールされると、Seurat Diskを起動する。起動成功。 > library(SeuratDisk) Registered S3 method overwritten by 'SeuratDisk': method from as.sparse.H5Group Seurat