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じっと見る #猫 #cat

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From Senri-Chuo to Shin-Osaka 千里中央から新大阪

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#東海道肉づくし #ekiben #駅弁

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シングルセルゲノミクス研究会に参加して僕なりのまとめ

主流はSingle cell RNA-seq。しかしそれだけでは不十分ではない。 理由1: 生命を理解するには、その情報だけでは不十分 理由2: シーケンスコストがそろそろ頭打ちになるので、これ以上リード数(≒細胞数×サンプル数)を増やすことができない。 次の技術として ・RNA velocity:Intron/exon 比を計算して、遺伝子の発現量だけでなく、その遺伝子発現量が上昇または減少する傾向にあるということも決める ・scRNA-seq + scATAC-seq :一般的にATAC-seqのほうがRNA-seqよりも変化が緩やか。 ・RamDA-seq:PolyAに頼らないRNA-seq Library prep.50%程度は、Non-poly A RNAなので、この方法だとよくRNA情報が取れる

好きなことを仕事にする

僕の好きなことは以下 トラベル バイオロジー コーヒー 教育 プログラミング 芸術 アフリカ これらでお金もらえないかな

出張の際の荷物

前提 ・スーツは着ない ・ビジネスホテルに泊まる ・3泊以内 1.無印そのまま洗える衣装ケース 基本的に下着しか持っていかない。それを入れるケースに、洗濯ネットのようになっている衣装ケースを使っている。これなら帰ってすぐに洗濯機に入れることができる。 2.モンベル 軽い折りたたみ傘 傘だとかなり邪魔だし、90%ぐらいの確率で電車などで忘れるので、折りたたみが良い。モンベルの傘はかなり小さいが軽いので、持っている気にならないのがいい。 3.10インチタブレット これは会社から支給されたもの。 4.ブルートゥースキーボード これを使うとタブレットがパソコンのようになって良い 5.USB-Cケーブル これは必要だよね。 以上です。

新幹線の無料Wifiはなぜ30分ごとにログインしなければならないのか

普通疑問系のタイトルであれば、本文に答えが書いてあるものだが、このブログは個人的なメモなのでもちろんただの疑問のままである。 そもそも世の中には無駄なものが多すぎる。無料Wifiはその最たるものだ。ログインをする意味が全くわからない。しかも新幹線は30分ごとにログインしなければならない。なんのためだろう。 早く、衛星からWifiを飛ばして、空が見えていればどこでもWifi がつながるようにしてほしいものだ。

#なにわ御膳 #駅弁 #Ekiben 最近旅行と出張が多いので駅弁記録でもとってみる。

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fastqファイルから配列情報だけを抽出する方法

fastqファイルは1リードが4行で表示され、2行目に配列(ATGC)が書かれてあります。 awkを使って以下のように書けば、2行目のみ抽出できます。 awk '{if(NR%4==2){print}}' ○○.fastq また、fastqがfastq.gzと圧縮されているときはまずはzcatで展開して、awkで2行目のみ抽出します。 zcat ○○.fastq.gz  | awk '{if(NR%4==2){print}}' #biology#bioinformatics

学会発表のポスター作成方法

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1. スライドのサイズをA0にする ファイル>ページ設定>カスタム 84.1 cm x 118.9 cm 2. ガイドを表示して、外枠3 cmずつ枠を取る 表示>ガイド>ガイドを表示 ガイドの上で右クリックして、ガイドを追加する。 以下の位置にガイドを設置する。 縦: 3 cm, 81.1 cm 横:3 cm, 115.9 cm 参考文献 http://k-connex.kyoto-u.ac.jp/ja/wp-content/uploads/sites/2/2016/07/160711-posterseminar-pub.pdf https://tsutawarudesign.com/miyasuku5.html