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7月, 2025の投稿を表示しています

Google photoの消しゴムマジックすごいな

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 総文祭で美術作品を写そうとしても人が写ってしまうので、消しゴムマジックで消してみた。 消す前(人の顔は黒く塗りつぶしてある) 消した後 左側の人を消した。びっくりしたのは後ろの美術作品がちゃんと復元できていること。消しゴムマジックは、ただ後ろの背景を予測するだけかと思っていたのだけど、ほぼ完璧に修正できるのか。もしかしたらずっと動画で撮っているので、後ろの背景も情報としてあるのかもしれない。すごい。これをさり気なくアップデートするGoogle もすごい。

かがわ総文祭の美術部門に行ってきた #行動する

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総文祭は、文系のインターハイ。毎年どこかの県が持ち回りらしいけど、今年は香川県らしい。日曜日に、高松市美術館で美術部門の総文祭があったので、行ってきた。 みんな素晴らしいな。こういうので県外に行けるというのも羨ましい。

スマホ買い替えるか微妙

 Pixel 7aを使っているけど、子供が落として画面が割れた。修理に2万、新しいPixel 9aは7万円。迷うなー。性能的にはPixel 7aで満足しているけど、画面が割れているのが厳しい。

香川県のベストレストラン

海鮮食堂 じゃこや #5star #食べる

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  道の駅の食堂だけど超人気。

gemini cliのインストールの仕方

 # nvmをインストールする wget -qO- https://raw.githubusercontent.com/nvm-sh/nvm/v0.39.7/install.sh | bash # 再起動する # Node.jsのバージョンをあげる ``` # Node.jsの最新LTS版をインストール nvm install --lts # インストールしたバージョンを使用 nvm use --lts # バージョンを確認! (今度こそ v20.x.x のように表示されるはずです!) node -v ``` # gemini-cliをインストールする ``` sudo npm install -g @google/gemini-cli ```

高浜海水浴場 #5star #行動する

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 夏なので海へ。本当は泳ぎたいけど、1歳の子どもがいるのでとりあえず足をつけるぐらいに。 車で30分。高浜海水浴場へ。夏なのに人が少ない。いいね。そこまで整備はされていないけど。シャワーも更衣室もないけど。とてもいい。

「横から失礼します」は本当に失礼なのでやめて #考える

 ビジネスメールだと、たいてい関係者がCCに入っている。入れなくてもいいと思うが、入れなくてトラブルになったときに面倒なので入れる場合が多いと思う。 ほとんどの場合は、送り合っている二人の会話になるが、たまに、「横から失礼します」といって、誰かが割り込むことがある。それが本当に失礼である。というか失礼しますっていうぐらいだから、やらないでほしい。ほとんどの場合、噛み合わないし、割り込まれた方はその人とどう接していいかよくわからない。 メールのCCとかBCCとか本当にやめてほしい。チャットにより、メールが撲滅するかと一瞬思ったが全く撲滅しないし。メールがなかった時代はどうしてたんだろう。CCを撲滅できるようなサービスが出てくればいいのだけど。 本当に失礼だからね。

東信 #4star #食べる

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 職場の近くにこんな人気店があるなんて。魚を中心としたお店。お刺身も天ぷらも煮物もある。 今回ははまちとマグロの漬け丼を頼んだ。僕にとっては魚の2トップ。美味しい。 ただ、金額が2000円ぐらいなので普段使いにはちょっとしにくいかな。クオリティは間違いなく値段に見合う価値はある。

直島新美術館 #4star #行動する

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 ベネッセミュージアムが自動車が停められなかったので、急遽直島新美術館へ。5月にできためちゃくちゃ新しい美術館。直島という島の中心地でもないところに、目立たない美術館ができて、人がたくさんいて、有名な作品があるのがとても違和感。 駐車場から階段で、大変だった。安藤忠雄建築で、どこが入り口かわかりにくい。 最後の作品は村上隆の作品で、以前京都の京セラ美術館で見た。その時は、ものすごい人で、しかも京都市という都会の展示だったのだが、今回は離島でしかも人も少ないところにこの作品があるのが違和感。 https://amufaamo.blogspot.com/2024/09/4star.html すごいけど、この美術館本当に存続できるのか?

万博VR、面白くないが続けている #行動する

 https://amufaamo.blogspot.com/2025/06/vr.html 一日一個のパビリオンを目標にやっているが、全く面白くない。これは失敗だと思う。 まず、日本以外のパビリオンがやる気ない。フランスとかアメリカでさえ、パビリオン内に入っても何もない。 なんか、本物の万博を動画でとってうまくVR取れないのかな。

直島に行ってきた #行動する

 ただの休日に直島に行ってきた。瀬戸内国際芸術祭が始まると激混みすることがわかっていたのでその前に行くことにした。 そして今回は車で行くことに。子供がいるので猛暑の中の移動はきついだろうということで。フェリーは一人1000円以下だが、車で入ると7000円以上するのでかなり割高。普通は行かないほうがいい。 フェリー出航の1時間前ほどにつき、車を停めてチケットを買う。余裕があったのでスムーズに行けた。 フェリーは結構綺麗。人もまぁまぁいた。これは芸術祭があると大変そうだ。 車で移動していると、サイクリングしている人が結構いた。超猛暑だけど大丈夫だろうか。 ベネッセミュージアムに行こうとしたら、あそこは宿泊者以外は車を停められず手前からバスで行く必要があるらしい。係のおじさんが優しくて、一応聞いてくれたがやっぱりダメらしい。ということでベネッセは諦めて直島新美術館に行くことにした。 続く

参議院選挙に行った。暑すぎた。 #行動する

3年に一度の参議院選挙の投票日。午前中に歩いて行ってきた。あまりにも暑かった。近くの小学校までほぼ影なし。しかも子供が抱っこと言ってきたので抱っこして左手には日傘。汗だく。 選挙の時はいつも思うけど係の人が私服だしなんか田舎の集会の雰囲気がある。一度やってみたいな。選挙管理委員会。

タスク管理はタスクを実行するだけでなく、整理や取捨選択も含む #学ぶ

 打ち合わせCastというポッドキャストの2025年のタスク管理という回を聞いた。 タスク管理はいかに今あるタスクを実行するかに焦点が当てられがちだが、実際は何をするか、何を優先するか、何をしないかを決めることも含めてタスク管理であるという話だった。そうなると仕事も私生活も全て関係してきて、結局は人生管理にような感じになる。後回しも戦略である。

ハラミラボ #4star #食べる

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その名の通りハラミが美味しいお店。わかりにくいところにあるがかなりの人気店。一回も冷凍を挟まずに提供しているらしい。ハラミは大体二千円ぐらい。その中でも1番高い、オールブルーランチというのを頼んでみた。三千六百円。ほとんどたべることができずに、持ち帰った。 ただ、オールブルーランチはそんなにおすすめしない。そもそもハラミの量が少ないし、唐揚げとかご飯でか様している感じがある。ここにくるならハラミを頼むべき。 再訪してハラミステーキ食べた。絶対ここはハラミを頼むべき。 美味しいのだけど、ちょっと高いかなということで4star

ブログの記事からタグクラウドを作るBlog-to-tagcloud #作る

https://github.com/amufaamo/blog-to-tagcloud Blogger Word Cloud Generator 📝☁️ Blogger(Blogspot)で運営されているブログの記事を分析し、単語の頻出度をランキング表示して、ワードクラウド画像を生成するPythonスクリプトです。 あなたのブログがどんな「言葉」でできているか、可視化してみましょう! ✨ 主な機能 Bloggerブログ対応: 公開されているBloggerブログであれば、どのブログでも分析可能です。 期間指定: 「直近30日間」「1年間(365日)」など、分析したい期間を自由に指定できます。 外部ファイルによる除外ワード指定: stopwords.txt を編集するだけで、分析から除外したい単語を簡単に管理できます。 2つの実行方法: Webブラウザだけ(Google Colab)で動かす方法と、自分のPC(ローカル環境)で動かす方法に対応しています。 🚀 使い方 方法1:ブラウザで簡単に実行 (Google Colab) PCへの環境構築は不要です。以下のボタンをクリックするだけで、スマホやPCのブラウザから直接ワードクラウドを生成できます。 Open In Colab 実行手順: 上の「Open In Colab」ボタンをクリックします。 表示されたページで、あなたのブログURLとGitHubリポジトリURL、分析したい日数を入力します。 フォームの下にあるコードの左側にある再生(▶)ボタンをクリックします。 しばらく待つと、単語ランキングとワードクラウド画像が表示されます。 方法2:自分のPCで実行 (ローカル環境) リポジトリをクローン git clone [https://github.com/amufaamo/blog-to-tagcloud.git](https://github.com/amufaamo/blog-to-tagcloud.git) cd blog-to-tagcloud ライブラリをインストール pip install requests beautifulsoup4 janome wordcloud matplotlib スクリプトを実行 ターミナルで create_wordcloud_local.py を実行します。--urlと...

過去30日、182日、365日のこのブログのタグクラウド

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 30日 182日 365日

サーモスさん、食洗機対応の250ml水筒を出して

 250mlの水筒が最高だと思ってる。それ以上飲むならペッドボトルを買った方がいい。サーモスに250mlの水筒が売ってるが、食洗機対応じゃない。対応じゃないと外の塗装が剥がれる。これは実体験としてやったからわかる。 250ml出してくれれば一生ついて行くよ。

一生懸命やっても10歩進んで9歩下がる感じ #考える

日々ゴールに向けて頑張っているが、どうしても後戻りする。ちょっと進んでゴールを夢見ているが戻されて落ち込む。でもそれが普通かも。10歩進んで9歩下がるのなら、100歩進めばいい。

なにを楽しみに生きているかわからなくなったので友人に聞いてみた #学ぶ

 最近仕事が忙しく、何のために仕事を一生懸命するのかよくわからなくなってきた。そこで友人何人かにLINEで聞いてみた。 ただ内容は何が楽しくて生きているかというもの。 その答えで共通しているのは、日々の生活を楽しむというもの。毎日の食事、睡眠、犬と遊ぶなど。確かに毎日ゲーム買ったりするわけじゃないから、日にの生活を楽しむしかないな。

無事健康診断(採血)終了 #行動する

定期健康診断。採血以外は本当にどうでもいいんだけど採血が苦手すぎる。 ただ、今回の看護師さんは良かった。はじめに「いい血管だから大丈夫です」と安心させてくれた。いい血管って初めて言われた。 採血はチクっとする痛みも嫌だが、刺さっている時も緊張感が半端ない。必死で南の島で昼寝している光景を思い浮かべたが、ちょっと疲れた。

論文 Solid-state cultivation of Aspergillus oryzae using insoluble plant cell wall polysaccharides and expression analyses of plant polysaccharide degradation-related enzymes #作る

Solid-state cultivation of Aspergillus oryzae using insoluble plant cell wall polysaccharides and expression analyses of plant polysaccharide degradation-related enzymes Tomohiko Matsuzawa 1, Masakazu Ishikawa 2, Shimma Fujiwa 1, Naoki Shimada 1, Hiroshi Kanzaki 3 Aspergillus oryzae produces multiple plant polysaccharide degradation-related enzymes, which make an important contribution to brewing and biotechnology. In this study, to clarify the mechanisms underlying the enzymatic degradation of plant cell wall polysaccharides by A. oryzae, we prepared insoluble plant cell wall polysaccharides from two plants, mung bean hypocotyls and Chinese chives, and used these as substrates for solid-state cultivation of this fungus. A. oryzae secretes numerous types of carbohydrate-active enzymes that are involved in the degradation of cellulosic and hemicellulosic polysaccharides among insoluble plant cell wall polysaccharides. Transcriptomic analyses revealed that genes encoding both characteriz...

やっぱりiPadに物理キーボードをつなげるのはやめよう #考える

 https://amufaamo.blogspot.com/2025/01/ipad.html iPadはタッチが一番使いやすいので物理キーボードをつなげるのはよくない。

github pageにjekyllテーマを適応する方法

 Readme.mdはindex.mdにしておく _config.ymlファイルを作る そのファイル内に以下のように書く。 theme: jekyll-theme-cayman title: あなたの素敵なサイト名 description: このサイトの簡単な説明をここに書きます。 テーマは以下。 https://pages.github.com/themes/ 参考 https://amufaamo.blogspot.com/2025/07/github.html

Githubを使って簡単にウェブサイトを作る方法

 1. リポジトリを作る 2. Readme.mdを編集する 3. Settings > Pagesに移動する。     3.1 Branchをmainに変更する。 これだけで簡単なウェブサイトができる。

自分を甘やかすモードから思いやるモードへ

http://amufaamo.blogspot.com/2025/07/blog-post_10.html 精神的身体的も安定し、甘やかすモード終了。だが頑張るモードまでは行かないので思いやるモード。甘やかすモードは暴飲暴食、爆買いを容認するけど、思いやるモードはそれはセーブ。そのかわり食べたいものは食べる。やりたいことをする、適度に休憩する。

政治家に任せず自分自身で頑張るしかない #考える

参院選で、給付か減税かで争っているみたいだけど、そもそも参院選前にさっさとやっとけよと思う。さらにすべての党が過半数取れないとどれもお蔵入りになる可能性がある。給付の2万円は貧乏な僕にとっては嬉しいし、減税も嬉しい。でも年間数千万を受け取っている政治家にとっては本当にやってもやらなくてもどうでもいい話なんだだろうな。 「たかが一票」というのはほんとうにたかが一票。僕の一票がどうなるわけでもない。「されど一票」とか言うのは本当にまやかし。と言っても僕が総理大臣になったからと言って変わるものでもない。 僕ができることは、自分自身で保身すること。率直に言うと、給料を上げること。給料が上がれば、自分の生活も楽になるし、子どもの養育も楽になるし、寄付もできる。さらに自分のやりたい仕事をする、楽な仕事をするというのも大事。ということで、選挙の応援に行くぐらいなら自分のスキルを上げて一生懸命頑張るしかない。

コリコランワイド #5star #使う

パナソニックの健康器具。コリを取るやつだが、低周波治療器のようにビリビリも何も感じない。買ってよかったというかもう必需品。 利点 一日中つけてられる。 USBC充電。 アタッチメントを変えれば腰でも肩でも使える 欠点 値段が高い 3万円以上 夏は蒸れる 根治はしない。

AmazonでUS配列のMacbook airが買えるのは朗報

 別にMacでもWindowsでもいいけど、ノートパソコンはMacbook Airだけ選べばいいと思っている。それだけ完成度が高いし、値段も安い。 AmazonだとUS配列が選べなかったのだが、今見るとUS配列も選べるみたい。これはいいね。定期的に安くなるし、型落ちでも十分だし、Macbook Airいいよ。

香川大学医学部の売店ではブラックモンブランが売っている

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  ブラックモンブランは基本的に九州で売っているアイス。僕の故郷は山口県だけど、山口でも売っていた。僕にとって定番、王様のアイスはガリガリくんでもチョコモナカジャンボでもなくて、ブラックモンブラン。そのブラックモンブランが香川大学医学部の売店に売ってた。 香川も一応西日本なので普通にブラックモンブランが売ってるかと思ったが、普通のスーパーでは売ってない見たい。かと言って大々的に宣伝している雰囲気もないから、特別に仕入れているわけでもなさそう。たまたまここが仕入れているだけかな。 現在「自分を甘やかす」モードなので買って食べてみた。やっぱり王様な気がする。だけど山口から離れて久しいので、チョコモナカジャンボも追い上げている。

「自分を甘やかす」モード発動

暑さには強い方だと思うけど、炎天下の車に乗り降りすることが多くなり、さらに仕事がたくさんになってきたので、体力的精神的に疲労してきた。このまま行くと体調を崩しかねないので「自分を甘やかす」モード発動。 一応3段階あって、頑張るモード、自分を思いやるモード、自分を甘やかすモード。それより下になったら閾値を超えたということで、怒ったり病気になったりする。そうならないように、普段我慢している贅沢などをちょっとするモードが「自分を甘やかす」モード。

じゃんめん #食べる #4star

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  香川大学医学部近くにあるラーメン屋。高知が発祥らしい。以前11時半ぐらいに行ったときに、並んでいたので諦めていた。とても田舎なところなので、それで11時半に並ぶのは相当人気だろうと思い、開店の11時ごろに伺う。するとやっぱり並んでいた。炎天下の中、外で待つ。もうちょっと並んでいたら多分倒れていた。 ただし、並んではいたが、席が一杯というわけではなかった。口コミから見るに、タッチパネルの選択がわかりにくくていつも並ぶらしい。 ここのラーメンは、ご飯にあうラーメンということで、あんかけのスープ。ご飯も一緒に頼んだ。結果、かなり美味しい。 けど、千円ごえはちょょっと高い印象。なんとなくシンプルな盛り付けだから、もうちょっと安くてもいいんじゃないかと思って、5Starにはならず。

スイカを毎日食べる #考える

 とにかくスイカが大好きで、スイカがスーパーに売っている時期は毎日食べていこうと思う。だいたい5月の終わりから、9月の終わりぐらいまで売っているので、それまでは毎日食べる。なんかスイカを食べるとそれだけで幸せになる。

暑すぎてちょっと気分悪くなった

 なんか香川は暑すぎる。 最近仕事が忙しいのもあって、疲れからかちょっと気分悪くなってしまった。食欲もあまりない。 ジュースを飲んだが、体調戻らず。 ただし、コンビニでウィダーインゼリーを飲んだら、結構回復した。閾値を超える前に、休むって結構大事。

三びきの子ぶた #食べる #5star

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 河原町駅前にあるフルーツパーラー。と言ってもBLTサンドとかちゃんとした食事もある。 初めてだったので、一番高いフルーツボールを頼んだ。1500円。 写真だとわかりにくいが、確実に2人前ある。ソフトクリームが二個のってるし、フルーツもそれぞれペアである感じ。フルーツは、ドラゴンフルーツなど変わったものもあり、満足度高い。これで1500円は安い。二人できたらこれを一個頼めばちょうどいい。 果物屋がやっている店らしいので、ハズレはない。

Evidence for the Contribution of Ciliates to Denitrification in a Eutrophic Lake #学ぶ

ハイブリッドリアクターにおけるバイオフィルムと活性汚泥の微生物群集の組成と発達を比較した研究をまとめたものです。 主な内容は以下の通りです。 研究目的: ハイブリッドリアクター(IFAS-MBSBBR)におけるバイオフィルムと活性汚泥の細菌群集の組成と発達を比較し、特に窒素とリン除去におけるそれぞれの役割と、微生物間の相互作用を明らかにすること。 方法: 16S rRNAシーケンスを用いて細菌群集の組成を分析し、アルファ多様性、ベータ多様性、およびネットワーク分析を用いて統計的に解析しました。 主な結果: 多様性: バイオフィルムの細菌群集は、活性汚泥よりも豊かで多様でした(OTU数、Chao1指数、Shannon指数が有意に高かった)。 優勢な門: 両方の環境でProteobacteriaとBacteroidotaが最も優勢な門でしたが、バイオフィルムではChloroflexi、Acidobacteriota、Nitrospirotaが、活性汚泥ではActinobacteriotaとPatescibacteriaが特徴的でした。 群集の安定性: バイオフィルムの群集は、活性汚泥の群集よりも環境条件の変化(曝気戦略など)に対して耐性があることが示唆されました。 機能性: バイオフィルムは、硝化細菌(例:Nitrosomonas、Nitrospira)やリン蓄積生物(Candidatus Accumulibacter)の増殖により適した環境でした。また、バイオフィルムネットワークでは、窒素およびリン除去効率との関連性がより多く見られました。 微生物間の相互作用: バイオフィルムの細菌は活性汚泥の細菌よりも互いに密接に相互作用していることが、ネットワーク分析で示されました。 キーとなる分類群: バイオフィルムではParacoccus、Phaeodactylibacter、Pseudoxanthomonas、活性汚泥ではDongia、Diaphorobacter、Rhizorhapisが中心的な役割を果たす分類群として同定されました。 結論: バイオフィルムと活性汚泥の微生物群集は構造が異なり、バイオフィルムは細菌組成がより多様で、窒素およびリン除去に重要な役割を果たす可能性が示唆されました。また、低存在量の細菌でも群集内で重要な役割を果たす可能性があることが示されました...

Exploring the microbial savanna: predator- prey interactions in the soil #学ぶ

この論文は、土壌における微生物の捕食者と被食者の相互作用、特に原生動物の捕食者とバクテリアの被食者との関係を探るものです。著者のLaura Sanchis PlaとJordi van Gestelは、分子システム生物学と微生物生態学を統合した研究アプローチを提唱し、捕食者と被食者の相互作用が微生物の生活史戦略と個体群動態をどのように形成するかを解明することの重要性を強調しています。 要約のポイント: 土壌生態系の複雑さ: 土壌は、ほとんどが微生物である多様な捕食者と被食者種を含む、複雑な多栄養群集を形成しています。 原生動物とバクテリアの相互作用: 殺菌性原生動物は土壌の主要な捕食者であり、バクテリアの個体群に大きな影響を与えます。原生動物は、化学走性シグナルによる誘引、偽足による捕獲、ろ過摂食など、多様な攻撃メカニズムを持っています。 捕食後の消化: 摂食後、原生動物は食作用を通じて被食者を消化します。このプロセスには、酸性化、酵素消化、酸化ストレス、金属欠乏、金属中毒など、一連のストレスが関与します。 バクテリアの防御メカニズム: バクテリアは、捕食を避けるために様々な防御メカニズムを進化させています。これには、毒素や界面活性剤などの小分子の分泌による捕食者の撃退、運動性、サイズ、形状の変化(例えば、フィラメント状になったり、バイオフィルムを形成したりする)による摂食の防止、さらには摂食後に食作用プロセスを妨害する受動的または能動的な抵抗が含まれます。 生活史のトレードオフ: 微生物が発現できる攻撃または防御メカニズムの数には限界があり、多くは成長、分散、生存といった重要な生活史特性に影響を与えるコストがかかります。 統合的アプローチの必要性: 文書は、土壌環境の文脈で捕食者と被食者の相互作用を理解するために、分子システム生物学と微生物生態学の手法を組み合わせた統合的な研究アプローチを求めています。CRISPRのような遺伝子工学や、合成土壌を用いたマイクロ流体実験などの最近の技術進歩が、このアプローチを促進すると述べられています。 最終的に、この文書は、原生動物の捕食者とバクテリアの被食者の生活史戦略がどのように生まれ、進化し、ひいては土壌の微生物群集、すなわち「微生物のサバンナ」を形成するかを探求することの重要性を強調しています。 

Geminiに聞いて参院選で投票する政党について聞いてみた

Geminiの質問 香川選挙区の候補者選び、お悩みですよね。それぞれの候補者の考えを知るために、いくつか質問をさせていただきますね。これらの質問に答えることで、ご自身の考えに近い候補者が見つかるかもしれません。 経済・税金について  * 質問1: 物価高騰への対策として、どのような方法が最も効果的だと思いますか?    * A. 消費税の減税    * B. 企業への支援による賃上げ促進    * C. 給付金の支給  * 質問2: 日本の経済を成長させるために、何が最も重要だと思いますか?    * A. 中小企業支援    * B. AIなどの成長分野への投資    * C. 減税による個人消費の活性化 社会・くらしについて  * 質問3: 少子化対策として、どのような支援が最も必要だと思いますか?    * A. 教育費の無償化    * B. 若者への経済的支援(ベーシックインカムなど)    * C. 雇用の安定化  * 質問4: 食料自給率の向上は、どの程度重要だと思いますか?    * A. とても重要    * B. ある程度重要    * C. あまり重要ではない 平和・外交について  * 質問5: 日本の安全保障について、どのようにお考えですか?    * A. 憲法9条を守り、平和外交に徹する    * B. 防衛力を強化し、他国との連携を深める    * C. 集団的自衛権の行使を容認する これらの質問にご回答いただければ、それぞれの候補者の政策と照らし合わせて、より詳しくご説明できますよ。 私の回答 質問1: 物価高騰への対策として、どのような方法が最も効果的だと思いますか?    * A. 消費税の減税  * 質問2: 日本の経済を成長させるために、何が最も重要だと思いますか?    * C. 減税による個人消費の活性化 社会・くらしについて ...

Bac2Feature: an easy-to-use interface to predict prokaryotic traits from 16S rRNA gene sequences #学ぶ

この論文の主な内容は以下の通りです。 Bac2Featureの提案 : さまざまな予測方法を標準化された形質データセットに統合し、予測性能を体系的に評価するウェブツールとしてBac2Featureが提案されています。 予測方法の評価 : ホモロジー、タクソノミー、系統発生に基づく3つの予測方法を比較し、系統発生に基づく予測が最も高い精度を示すことが示されています。特に、ゲノムサイズや至適増殖温度などの連続形質においてその優位性が顕著です。 予測精度と系統発生シグナルの関連性 : 予測精度が系統発生シグナルと強く関連していることが示されており、形質の系統発生的保存性が予測の信頼性に影響を与えることが示唆されています。 予測閾値の設定 : 偽りの予測を避けるため、系統発生距離に基づいて予測閾値が設定されています。ゲノム形質は高い閾値を示し、細胞サイズや至適pHなどの形質は低い予測精度のため除外されています。 実際のマイクロバイオームデータへの応用 : 乳児の腸内マイクロバイオーム、湖水、農業土壌のデータセットにBac2Featureを適用することで、その有効性が実証されています。特に、乳児の腸内マイクロバイオームでは、増殖速度やtRNA遺伝子コピー数の変化などの新たな知見が得られています。 利点と限界 : Bac2Featureは、既存のツールと比較して、複数の予測方法を統合し、広範囲の形質を予測し、信頼性を高めるための閾値を設けている点が利点として挙げられています。一方で、細胞サイズや至適pHなどの一部の形質では予測精度が低いこと、動物関連環境に偏りがあることが限界として認識されています。 このツールは、微生物生態学や医学研究など、さまざまな分野で形質に基づくマイクロバイオーム解析を容易にすることを目的としています。

chafu #食べる #5star

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 香川に来て8ヶ月。毎日通っている道だけど、気づかなかったカフェを見つけた。入口もよくわからないし、車も入りにくいが、お客さんはまぁまぁいる。 古民家カフェっぽいし、庭もあって落ち着ける。店員もお客さんもなんか落ち着いている。 モーニングのフレンチトースト。ボリュームもあって、珈琲も美味しいし最高だった。ありがとうGoogle map。君がいないと気付けなかったよ。

日程調整の面倒さ #考える

 ありがたいことにいろんな人と仕事をさせていただくことになった。ミーティングの機会も増えてきたが日程調整が結構面倒である。 こちらの日程を考え、相手に送る。相手がそこから選ぶ。それに返信する。最短でそのやりとり。忙しい人通しだともっとやりとりが増える。 その面倒さを避けるために、アプリを作ろうかな。

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