LoupeRのインストール

 LoupeRとはなにか？

Seuratオブジェクトから.cloupeファイルを作成するためのRパッケージ。

インストール

R上でまずは以下のツールをインストール。

install.packages("hdf5r")

install.packages('Seurat') 

install.packages("remotes")

 

その次に、LoupeRをインストール。Githubから直接インストールします。

remotes::install_github("10xGenomics/loupeR")

loupeR::setup()

無事にインストールできたらLoupeRを呼び込みます。

library(loupeR)